首先检查体表。从鱼池捞出病鱼或新死的鱼，置于瓷盘中，按顺序从头部、嘴、眼睛、鳃盖、鳞片、鳍条等仔细观察。检查皮肤有无发炎、红斑、白点、寄生虫、鳞片突出竖立或其他异物，或黏液增多。然后检查鳃，轻轻挑起鳃盖，观察鳃丝的颜色是否鲜红或发白、黏液是否增多，有无缺损、糜烂，以及其他病变。
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最后检查内脏，以检查肠道为主，看病鱼的排粪情况与健康鱼有无不同，肛门处是否异常红肿或有黏液流出。必要时进行解剖，检查肠道，看是否红肿充血。