住院抑郁障碍病人的死亡率是正常人的2倍，原因主要是自杀，还有并发血管性疾病（如动脉硬化）和其他躯体疾病的共病率增加。有研究发现，抑郁发作与其后的自体免疫疾病、肿瘤的发病有关。有15%住院抑郁障碍病人最终死于自杀。也有人认为，绝大多数自杀发生出院以后，出院后2年自杀率达到高峰；病情较轻的门诊病人，常因合并酒精依赖或人格障碍等因素，会使自杀危险性升高。