实施搅拌主要有以下４种方法。
第一种方法是人工摇动培养容器使细菌上浮，这种方法仅适
用于三角烧瓶和细口瓶等小型培养容器。搅拌时以液面微起波纹
而无漩涡为适度，每天定时摇动３～４次。
第二种方法是用磁力搅拌器搅拌，将三角烧瓶和细口瓶等玻
璃培养容器放于磁力搅拌器上，启动磁力搅拌器，带动培养容器内
的磁力搅拌棒工作，起到搅拌的作用。
第三种方法是用机械搅拌器搅拌或使用小水泵使水缓慢循环
运转，保持菌体悬浮。
第四种方法是充气搅拌，由于充气搅拌会使培养基中的溶解
氧大量增加，抑制光合细菌的生长，因此要采取连续充气的方法，
并且要严格控制充气量，使菌液中的溶解氧含量低于１毫升／升，
充气量一般控制在１～１?５升／小时。
前两种方法适用于小型培养容器，后两种方法适合于大型培
养容器。