从功能而言，有主火、水火共主、非水非火为肾间动气之不同。如明·赵献可认为命门即是真火，主持一身阳气。他在《医贯·内经十二官论》中说：“余有一譬焉，譬之元宵之鳌山走马灯，拜者舞者飞者走者，无一不具，其中间唯是一火耳。火旺则动速，火微则动缓，火熄则寂然不动……夫既曰立命之门，火乃人身之至宝。”清·陈士铎在《石室秘录》中也认为：“命门者，先天之火也。”明·张介宾则强调了命门之中具有阴阳水火二气，从而发挥对全身的滋养、激发作用。他在《景岳全书·传忠录·命门余义》中提出：“命门为元气之根，为水火之宅。五脏之阴气，非此不能滋；五脏之阳气，非此不能发。”明·孙一奎则认为命门在两肾中间，非水非火，只是存在着的一种元气发动之机，是一种生生不息造化之机枢而已，即《难经·八难》所谓的“肾间动气”。他在《医旨绪余·命门图说》中指出：“越人亦曰：‘肾间动气者，人之生命，五脏六腑之本，十二经脉之根，呼吸之门，三焦之原。’命门之意，盖本于此。……命门乃两肾中间之动气，非水非火，乃造化之枢纽，阴阳之根蒂，即先天之太极。”